JVNDB-2026-008292

SamtoolsのHTSlibにおける複数の脆弱性

HTSlibはバイオインフォマティクスのファイル形式を読み書きするためのライブラリです。CRAMはDNA配列アラインメントデータを保存する圧縮形式です。冗長なデータを除去する方法の一つとして、CRAMは参照ベースの圧縮を使用しており、各アラインメントレコードの完全な配列を保存する代わりに、外部参照配列内の位置と、その位置の参照に対する差異のリストを「特徴」として保存します。CRAMレコードをデコードする際、参照データは文字配列に格納され、アラインメントレコード配列に一致する部分が必要に応じてコピーされます。特徴データ系列の検証が不十分なため、`cram_decode_seq()`関数は格納された参照の開始前または終了後のデータを、CRAMレコード出力配列用のバッファやSAMの`MD`タグ構築用バッファにコピーする可能性がありました。これにより、任意のデータが呼び出し関数に漏洩するおそれがあります。このバグにより、プログラムの状態に関する情報漏洩が発生する可能性があります。また、無効なメモリアクセスを試みた結果、プログラムがクラッシュすることもありえます。バージョン1.23.1、1.22.2および1.21.1にはこの問題の修正が含まれています。この問題に対する回避策はありません。

Samtools

• HTSlib 1.21.1 未満
• HTSlib 1.22 以上 1.22.2 未満
• HTSlib 1.23

本脆弱性の影響を受ける製品の詳細については、ベンダ情報および参考情報をご確認ください。

当該ソフトウェアが扱う全ての情報が外部に漏れる可能性があります。
また、当該ソフトウェアが扱う情報について、書き換えは発生しません。
さらに、当該ソフトウェアが完全に停止する可能性があります。
そして、この脆弱性を悪用した攻撃の影響は、他のソフトウェアには及びません。

正式な対策が公開されています。ベンダ情報を参照して適切な対策を実施してください。

GitHub

• GitHub : Out-of-bounds read in HTSlib CRAM reader due to improper validation of input  Advisory  samtools/htslib  GitHub

1. 境界外読み取り(CWE-125) [その他]
2. 配列インデックスの不適切な検証(CWE-129) [その他]

1. CVE-2026-31966

1. National Vulnerability Database (NVD) : CVE-2026-31966
2. 関連文書 : Reject cram files with negative-length D, H, P or N features  samtools/htslib@2a45eb1  GitHub
3. 関連文書 : Catch cram records that start before the current reference segment  samtools/htslib@4a5ef25  GitHub
4. 関連文書 : Fix checks for CRAM features accessing data beyond ref_end  samtools/htslib@22ec523  GitHub

• [2026年03月24日]
    掲載